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生物信息培训VIP课程 – 带源码课件

  • 发布时间：
    2025-04-12 16:29:27
  • 文件大小：
    共计 253 个文件，合计：74.09GB
  • 资源来源：
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【基因学苑】生物信息培训VIP课程 - 2022 - 带源码课件74.09GB
01生物信息入门325.89MB
01生物信息入门.mp4325.89MB
02Linux基础6.38GB
02Linux介绍.mp4568.72MB
03Linux基础.mp4682.51MB
04目录结构.mp41.06GB
05文件操作1.mp4811.74MB
06文件操作2.mp41.31GB
07编辑脚本.mp41.13GB
08权限和任务管理.mp4889.02MB
03生物软件及数据库4.18GB
09生物软件简介.mp4332.99MB
10安装已编译软件.mp4679.01MB
11源代码编译.mp41.24GB
12环境配置.mp4184.81MB
13bioconda.mp4256.25MB
14腾讯云安装软件.mp4590.04MB
15虚拟环境.mp4524.03MB
16生物数据库管理.mp4441.69MB
04illumina测序原理及数据处理3.59GB
17测序数据下载.mp4667.07MB
18了解测序这件事.mp4405.66MB
19illumina测序原理之建库.mp4258.61MB
20illumina测序原理之测序.mp4464.22MB
21fastq文件介绍.mp495.49MB
22fastq文件处理.mp4753.34MB
23数据质控和过滤.mp41GB
05pacbio测序原理及数据处理602.98MB
24pacbio测序原理.mp4367.5MB
25pacbio数据处理.mp4235.48MB
06nanopore测序原理及数据处理1.22GB
26nanopore测序原理.mp4554.31MB
27碱基识别.mp4310.32MB
28nanopore数据处理.mp4382.28MB
07解决软件报错696.19MB
29解决软件报错.mp4696.19MB
08新冠病毒数据分析3.17GB
30新冠病毒测序.mp4428.35MB
31下载新冠病毒基因组序列.mp4353.68MB
32下载新冠分析数据库.mp4778.19MB
33新冠病毒快速鉴定.mp4396.77MB
34新冠参考基因组拼接.mp4350.68MB
35新冠病毒拼接结果验证.mp4422.28MB
36拼接新冠病毒基因组.mp4109.92MB
37ArticNetWork流程.mp4410.93MB
09构建系统发育树717.53MB
38构建系统发育树.mp4395.85MB
39iTol美化系统发育树.mp4251.57MB
40变种病毒识别.mp470.12MB
11拼接结果统计及评估960.89MB
46fasta格式文件介绍与处理.mp4206.09MB
47quast评估.mp4173.69MB
48busco评估.mp4104.55MB
49tablet以及bandage评估.mp4476.56MB
12基因组拼接探索723.27MB
50基因组拼接探索.mp4287.1MB
51混合拼接.mp4436.16MB
14基因组序列分析1.41GB
56原核生物基因预测.mp4491.14MB
57真核生物基因预测.mp4251.43MB
58基因功能注释.mp4274.25MB
59ncRNA分析.mp4229.23MB
60重复序列分析.mp4197.72MB
15序列比对1.21GB
61blast比对.mp4216.82MB
62blast使用案例.mp4693.37MB
63全局比对.mp4333.78MB
16共线性分析526.62MB
64共线性分析.mp4310.01MB
65MCScanX共线性分析.mp4216.61MB
17基因家族分析608.01MB
66基因家族分析.mp4608.01MB
18测序数据比对772.13MB
67测序数据比对.mp4291.02MB
68段序列比对练习.mp4207.85MB
69长读长序列比对.mp4204.44MB
70多重比对问题如何处理.mp468.82MB
19sam和bam文件处理625.09MB
71sam和bam格式文件介绍.mp4135.68MB
72sam和bam处理案例（上）.mp4293.57MB
73sam和bam处理案例（下）.mp4195.84MB
20Linux高级操作1.37GB
74生物信息常用文件格式.mp4166.94MB
75正则表达式.mp4139.2MB
76文件搜索.mp4408.35MB
77文本筛选grep.mp4392.63MB
78文本编辑.mp4297.28MB
21表格处理731.27MB
79cut-sort-uniq.mp4194.6MB
80表格处理awk.mp4241.65MB
81bioawk.mp452.84MB
82csvtk.mp499.86MB
83datamash.mp4142.32MB
22shell编程370.68MB
84shell变量.mp4133.08MB
85shell循环.mp4183.02MB
86shell判断.mp454.58MB
23生物信息分析服务器简介984.28MB
87服务器简介.mp4109.41MB
88硬件选购.mp4168.06MB
89安装操作系统.mp4139.6MB
90选择RAID.mp4122.04MB
91设置云服务器.mp4114.58MB
92yum工具.mp4222.74MB
93磁盘操作.mp4107.84MB
24生物信息分析平台搭建1.45GB
94基础环境配置.mp4296.75MB
95升级centos-stream.mp496.32MB
96重置服务器练习.mp4184.24MB
97用户管理.mp4303.28MB
98配置生物软件.mp4239.72MB
99配置生物数据库.mp486.35MB
100配置R语言分析环境.mp4195.1MB
101安装网络应用.mp478.08MB
25ubuntu系统配置212.8MB
102ubuntu系统配置.mp4156.22MB
103虚拟机安装ubuntu.mp456.58MB
26R语言基础入门1.62GB
104R语言简介.mp498.54MB
105R语言以及Rstudio安装.mp4128.98MB
106rstudio设置.mp4238.76MB
107开始使用R.mp4311.41MB
108R环境设置.mp4186.37MB
109R包管理.mp4398.24MB
110文件操作.mp4295.31MB
27R数据结构1.23GB
111向量.mp4150.78MB
112向量索引.mp4294.3MB
113矩阵.mp4126.21MB
114数据框.mp4422.41MB
115因子列表缺失数据.mp4270.18MB
28R数据处理2.03GB
116数据处理.mp4267.12MB
117数据转换.mp4447.32MB
118随机抽样以及数据探索.mp4380.76MB
119分组计算以及数据透视表.mp4298.2MB
120tidyverse.mp4300.81MB
121dplyr数据处理.mp4383.6MB
29R统计检验779.74MB
122独立性卡方检验.mp4219.38MB
123独立性t检验.mp4461.95MB
124相关性检验.mp498.41MB
30R统计建模852.74MB
125统计建模.mp4291.77MB
126购物篮分析.mp4270.01MB
127机器学习预测乳腺癌.mp4290.96MB
31R基础绘图1.72GB
128R语言技巧.mp4140.61MB
129R基础绘图.mp4246.87MB
130直方图.mp4490.47MB
131饼图以及扇形图.mp4101MB
132条形图以及分组条形图.mp4231.87MB
133箱线图以及小提琴图.mp4145.77MB
134韦恩图.mp4225.6MB
135绘图布局.mp4181.97MB
32ggplot2绘图2.26GB
136ggplot2绘图.mp4153.84MB
137ggplot2散点图直方图条形图.mp4363.93MB
138ggplot2分组条形图以及箱线图.mp4512.19MB
139ggplot2小提琴图以及主题设置.mp4245.77MB
140ggplot2扩展.mp4507.47MB
141科学文献绘图.mp4535.59MB
33基因表达调控简介498.87MB
142基因表达调控.mp4191.25MB
143GEO数据库简介.mp4231.89MB
144关于基因的概念.mp475.72MB
34RNAseq概述1.01GB
145RNAseq简介.mp4208.82MB
146RNAseq原理.mp4208.44MB
147RNAseq建库方法.mp4182.15MB
148RNAseq不同测序平台比较.mp4159.27MB
149RNAseq定量方法.mp4278.43MB
35RNAseq分析2.34GB
150RNAseq分析环境搭建.mp465.88MB
151Bioconductor.mp4245.71MB
152下载参考序列.mp4492.71MB
153下载练习数据.mp4326.77MB
154数据质控过滤.mp4425.05MB
155hisat2建立索引.mp4142.87MB
156hisat2比对.mp4240.31MB
157featureCounts计数.mp4131.42MB
158STAR比对.mp4163.17MB
159HTSeq-count计数.mp4159.83MB
36利用R分析RNAseq数据1.16GB
160DESeq2分析RNAseq数据.mp4411.71MB
161DESeq2练习.mp4117.1MB
162edgeR分析RNAseq数据.mp4391.21MB
163edgeR练习.mp4272.1MB
37差异表达基因注释以及富集分析1.61GB
164差异表达基因功能注释.mp4336.19MB
165富集分析.mp4386.1MB
166注释富集练习.mp4151.1MB
167非模式生物注释富集.mp4195.19MB
168GSEA分析.mp4584.03MB
38单细胞测序概述773.03MB
169单细胞测序概述.mp4295.76MB
170单细胞测序原理.mp4291.58MB
171_10xgenomics资源以及常见问题.mp4185.68MB
39单细胞测序数据分析1.08GB
172单细胞分析环境搭建.mp4307.2MB
173利用cellranger分析单细胞数据.mp4370.85MB
174结果解读.mp4195.2MB
175LoupeBrowser.mp497.35MB
176_10x练习数据.mp4140MB
40利用Seurat分析单细胞数据1.96GB
177安装Seurat.mp4285.38MB
178Seurat读取数据.mp4137.62MB
179质控过滤以及标准化.mp4184.39MB
180聚类.mp4241.5MB
181细胞亚群分类.mp4326.46MB
182寻找marker基因以及细胞鉴定.mp4442.69MB
183Seurat练习.mp4388.98MB
43空间转录组117.4MB
192空间转录组.mp4117.4MB
44宏基因组简介528.85MB
193宏基因组简介.mp4388.23MB
194宏基因组建库测序.mp4140.63MB
45宏基因组分析环境搭建365.05MB
195宏基因组分析环境搭建.mp4216.17MB
196国内镜像下载宏基因组数据库.mp4148.87MB
47临床病原微生物检测479.25MB
203临床样本病原微生物检测.mp4241.81MB
204批量进行致病菌鉴定.mp4237.44MB
49宏基因组分析结果可视化562.89MB
210megan物种分类结果可视化.mp4321.17MB
211stamp分组比较.mp4241.72MB
52宏基因组功能分析952.52MB
218宏基因组基因预测.mp4285.85MB
219cdhit去冗余.mp4215.29MB
220宏基因组基因功能注释.mp4203.61MB
221宏基因组定量分析.mp4247.76MB
53metawrap分箱748.72MB
222metawrap分箱.mp4182.9MB
223metawrap配置.mp4304.89MB
224metawrap案例.mp4260.93MB
54扩增子分析简介1.22GB
225扩增子测序简介.mp4314.66MB
226OTU还是ASV？.mp4129.86MB
227alpha和beta多样性.mp4208.72MB
228.16S分析环境搭建.mp4376.98MB
229metadata.mp456.07MB
230探索16S序列.mp4159.31MB
55利用qime2分析16S数据1.89GB
231qiime2简介.mp4224.19MB
232qiime2导入数据.mp4472.82MB
233qiime2实战.mp4432.3MB
234多样性分析.mp4359.43MB
235物种分类鉴定及可视化.mp4223.45MB
236不同组间丰度差异比较.mp4218.83MB
56利用R分析16S数据1.4GB
237拆分barcode.mp4145.84MB
238利用dada2处理16S数据.mp4471.17MB
239dada2物种分类鉴定.mp4269.36MB
240dada2练习案例.mp4204.37MB
241利用phyloseq可视化结果.mp4198.24MB
242.16S功能分析.mp4145.82MB
57人基因变异检测568.58MB
243人基因组分析简介.mp4204.58MB
244全基因组与外显子和panel测序.mp4116.58MB
245参考序列的影响.mp486.87MB
246拼接与reads比对方法比较.mp4160.55MB
58人基因组数据分析环境搭建546.95MB
247人基因组分析环境搭建.mp4416.01MB
248瓶中基因组.mp4130.94MB
61igv变异可视化178.96MB
260igv变异可视化.mp4178.96MB
10二代基因组拼接810.5MB
41了解基因组拼接.mp4157.64MB
42基因组拼接原理.mp477.06MB
43kmer估计基因组大小.mp4270.6MB
44二代测序拼接算法.mp468.38MB
45二代测序拼接实战.mp4236.82MB
13三代测序基因组拼接1.76GB
52pacbio及nanopore基因组拼接.mp4651.18MB
53组装结果纠错.mp4421.62MB
54细菌完成图.mp4434.14MB
55不同物种拼接练习.mp4290.75MB
46三代nanopore测序宏基因组数据分析1.32GB
197物种分类原理.mp4127.04MB
198centrifuge安装.mp4218.87MB
199centrifuge数据库.mp4156.53MB
201pavian结果可视化.mp4227.17MB
202物种分类练习.mp4232.66MB
200三代测序宏基因组物种分类鉴定.mp4391.57MB
48二代宏基因组测序数据分析1.44GB
207kneaddata质控.mp4244.2MB
208metaphlan物种分类.mp4298.17MB
209humann功能分析.mp4145.65MB
205二代宏基因组分析软件安装.mp4251.7MB
206二代宏基因组分析数据库下载.mp4535.19MB
50二代宏基因组拼接707.54MB
212二代宏基因组模拟数据拼接.mp4282.89MB
213二代宏基因组真实数据拼接.mp4424.65MB
51三代纳米孔宏基因组拼接1.28GB
215nanopore模拟数据拼接.mp4509.61MB
216nanopore宏基因组真实数据拼接.mp4285.34MB
217纳米孔组装纠错.mp4287.53MB
214三代纳米孔宏基因组拼接.mp4227.01MB
59二代测序变异检测2.93GB
249gatk简介.mp4144.75MB
250变异检测原理.mp490.91MB
251生成bam.mp4422.62MB
252bam文件处理.mp4512.93MB
253gatk变异检测.mp4419.13MB
254外显子与panel数据分析.mp4244.86MB
255vcf文件.mp4657.06MB
256snp注释.mp4508.61MB
60三代纳米孔变异检测550.71MB
257纳米孔测序变异检测原理.mp488.53MB
258纳米孔数据比对.mp493.72MB
259纳米孔测序SNP与SV检测.mp4368.46MB
课件.7z408.4MB
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